Utilizzare le funzionalità avanzate dei notebook Apache Beam

L'utilizzo di Apache Beam Interactive Runner con i blocchi note JupyterLab consente di sviluppare pipeline in modo iterativo, ispezionare il grafico della pipeline e analizzare singole PCollection in un flusso di lavoro Read-Eval-Print Loop (REPL). Per un tutorial che mostra come utilizzare l'esecutore interattivo Apache Beam con i notebook JupyterLab, consulta Sviluppare con i notebook Apache Beam.

Questa pagina fornisce dettagli sulle funzionalità avanzate che puoi utilizzare con il tuo notebook Apache Beam.

FlinkRunner interattivo su cluster gestiti da notebook

Per lavorare in modo interattivo con dati di dimensioni di produzione dal notebook, puoi utilizzare FlinkRunner con alcune opzioni di pipeline generiche per indicare alla sessione del notebook di gestire un cluster Managed Service for Apache Spark di lunga durata ed eseguire le pipeline Apache Beam in modo distribuito.

Prerequisiti

Per utilizzare questa funzionalità, procedi nel seguente modo:

  • Abilita l'API Managed Service per Apache Spark.
  • Concedi un ruolo di amministratore o Editor al account di servizio che esegue l'istanza del notebook per Managed Service per Apache Spark.
  • Utilizza un kernel del notebook con l'SDK Apache Beam versione 2.40.0 o successiva.

Configurazione

Come minimo, devi disporre della seguente configurazione:

# Set a Cloud Storage bucket to cache source recording and PCollections.
# By default, the cache is on the notebook instance itself, but that does not
# apply to the distributed execution scenario.
ib.options.cache_root = 'gs://<BUCKET_NAME>/flink'

# Define an InteractiveRunner that uses the FlinkRunner under the hood.
interactive_flink_runner = InteractiveRunner(underlying_runner=FlinkRunner())

options = PipelineOptions()
# Instruct the notebook that Google Cloud is used to run the FlinkRunner.
cloud_options = options.view_as(GoogleCloudOptions)
cloud_options.project = 'PROJECT_ID'

Provisioning esplicito (facoltativo)

Puoi aggiungere le seguenti opzioni.

# Change this if the pipeline needs to run in a different region
# than the default, 'us-central1'. For example, to set it to 'us-west1':
cloud_options.region = 'us-west1'

# Explicitly provision the notebook-managed cluster.
worker_options = options.view_as(WorkerOptions)
# Provision 40 workers to run the pipeline.
worker_options.num_workers=40
# Use the default subnetwork.
worker_options.subnetwork='default'
# Choose the machine type for the workers.
worker_options.machine_type='n1-highmem-8'

# When working with non-official Apache Beam releases, such as Apache Beam built from source
# code, configure the environment to use a compatible released SDK container.
# If needed, build a custom container and use it. For more information, see:
# https://beam.apache.org/documentation/runtime/environments/
options.view_as(PortableOptions).environment_config = 'apache/beam_python3.7_sdk:2.41.0 or LOCATION.pkg.dev/PROJECT_ID/REPOSITORY/your_custom_container'

Utilizzo

# The parallelism is applied to each step, so if your pipeline has 10 steps, you
# end up having 10 * 10 = 100 tasks scheduled, which can be run in parallel.
options.view_as(FlinkRunnerOptions).parallelism = 10

p_word_count = beam.Pipeline(interactive_flink_runner, options=options)
word_counts = (
    p_word_count
    | 'read' >> ReadWordsFromText('gs://apache-beam-samples/shakespeare/kinglear.txt')
    | 'count' >> beam.combiners.Count.PerElement())
# The notebook session automatically starts and manages a cluster to run
# your pipelines with the FlinkRunner.
ib.show(word_counts)

# Interactively adjust the parallelism.
options.view_as(FlinkRunnerOptions).parallelism = 150
# The BigQuery read needs a Cloud Storage bucket as a temporary location.
options.view_as(GoogleCloudOptions).temp_location = ib.options.cache_root
p_bq = beam.Pipeline(runner=interactive_flink_runner, options=options)
delays_by_airline = (
    p_bq
    | 'Read Dataset from BigQuery' >> beam.io.ReadFromBigQuery(
        project=project, use_standard_sql=True,
        query=('SELECT airline, arrival_delay '
               'FROM `bigquery-samples.airline_ontime_data.flights` '
               'WHERE date >= "2010-01-01"'))
    | 'Rebalance Data to TM Slots' >> beam.Reshuffle(num_buckets=1000)
    | 'Extract Delay Info' >> beam.Map(
        lambda e: (e['airline'], e['arrival_delay'] > 0))
    | 'Filter Delayed' >> beam.Filter(lambda e: e[1])
    | 'Count Delayed Flights Per Airline' >> beam.combiners.Count.PerKey())
# This step reuses the existing cluster.
ib.collect(delays_by_airline)

# Describe the cluster running the pipelines.
# You can access the Flink dashboard from the printed link.
ib.clusters.describe()

# Cleans up all long-lasting clusters managed by the notebook session.
ib.clusters.cleanup(force=True)

Cluster gestiti dal notebook

  • Per impostazione predefinita, se non fornisci opzioni della pipeline, Interactive Apache Beam riutilizza sempre il cluster utilizzato più di recente per eseguire una pipeline con FlinkRunner.
    • Per evitare questo comportamento, ad esempio per eseguire un'altra pipeline nella stessa sessione del notebook con un FlinkRunner non ospitato dal notebook, esegui ib.clusters.set_default_cluster(None).
  • Quando viene creata una nuova pipeline che utilizza un progetto, una regione e una configurazione di provisioning che mappano un cluster Managed Service for Apache Spark esistente, Dataflow riutilizza anche il cluster, anche se potrebbe non utilizzare il cluster utilizzato più di recente.
  • Tuttavia, ogni volta che viene apportata una modifica al provisioning, ad esempio quando viene ridimensionato un cluster, viene creato un nuovo cluster per attuare la modifica desiderata. Se intendi ridimensionare un cluster, per evitare di esaurire le risorse cloud, libera spazio dai cluster non necessari utilizzando ib.clusters.cleanup(pipeline).
  • Quando viene specificato un master_url Flink, se appartiene a un cluster gestito dalla sessione del notebook, Dataflow riutilizza il cluster gestito.
    • Se master_url non è noto alla sessione del blocco note, significa che è necessario un FlinkRunner self-hosted dall'utente. Il notebook non esegue alcuna operazione in modo implicito.

Risoluzione dei problemi

Questa sezione fornisce informazioni per aiutarti a risolvere i problemi e a eseguire il debug di Interactive FlinkRunner sui cluster gestiti dai blocchi note.

Per semplicità, la configurazione del buffer di rete Flink non è esposta per la configurazione.

Se il grafico del job è troppo complesso o il parallelismo è impostato su un valore troppo alto, la cardinalità dei passaggi moltiplicata per il parallelismo potrebbe essere troppo grande, causando la pianificazione di un numero eccessivo di attività in parallelo e l'esecuzione non riuscita.

Utilizza i seguenti suggerimenti per migliorare la velocità delle esecuzioni interattive:

  • Assegna a una variabile solo il PCollection che vuoi esaminare.
  • Ispeziona PCollections uno alla volta.
  • Utilizza il rimescolamento dopo le trasformazioni con fanout elevato.
  • Modifica il parallelismo in base alle dimensioni dei dati. A volte, più piccolo è più veloce.

L'ispezione dei dati richiede troppo tempo

Controlla la dashboard di Flink per il job in esecuzione. Potresti notare un passaggio in cui centinaia di attività sono state completate e ne rimane solo una, perché i dati in transito risiedono su una singola macchina e non vengono rimescolati.

Utilizza sempre il rimescolamento dopo una trasformazione con un elevato fanout, ad esempio quando:

  • Lettura delle righe da un file
  • Lettura di righe da una tabella BigQuery

Senza il rimescolamento, i dati di fanout vengono sempre eseguiti sullo stesso worker e non puoi sfruttare il parallelismo.

Di quanti worker ho bisogno?

Come regola generale, il cluster Flink ha circa il numero di vCPU moltiplicato per il numero di slot worker. Ad esempio, se hai 40 worker n1-highmem-8, il cluster Flink ha al massimo 320 slot, ovvero 8 moltiplicato per 40.

Idealmente, il worker può gestire un job che legge, mappa e combina con il parallelismo impostato a centinaia, il che pianifica migliaia di attività in parallelo.

Funziona con lo streaming?

Le pipeline di streaming non sono attualmente compatibili con la funzionalità Flink interattivo su cluster gestito da notebook.

Beam SQL e beam_sqlmagia

Beam SQL consente di eseguire query su PCollections limitati e illimitati con istruzioni SQL. Se lavori in un notebook Apache Beam, puoi utilizzare il comando magico personalizzato beam_sql di IPython per velocizzare lo sviluppo della pipeline.

Puoi controllare l'utilizzo della magia beam_sql con l'opzione -h o --help:

Controlla la guida di beam_sql

Puoi creare un PCollection da valori costanti:

Crea PCollection da valori costanti

Puoi partecipare a più PCollections:

Unire più PCollection

Puoi avviare un job Dataflow con l'opzione -r DataflowRunner o --runner DataflowRunner:

Avviare il job Dataflow con Apache Beam SQL

Per saperne di più, consulta il notebook di esempio Apache Beam SQL nei notebook.

Accelerare l'utilizzo del compilatore JIT e della GPU

Puoi utilizzare librerie come numba e GPU per accelerare il codice Python e le pipeline Apache Beam. Nell'istanza del notebook Apache Beam creata con una GPU nvidia-tesla-t4, per l'esecuzione sulle GPU, compila il codice Python con numba.cuda.jit. (Facoltativo) Per velocizzare l'esecuzione sulle CPU, compila il codice Python in codice macchina con numba.jit o numba.njit.

L'esempio seguente crea un DoFn che viene elaborato sulle GPU:

class Sampler(beam.DoFn):
    def __init__(self, blocks=80, threads_per_block=64):
        # Uses only 1 cuda grid with below config.
        self.blocks = blocks
        self.threads_per_block = threads_per_block

    def setup(self):
        import numpy as np
        # An array on host as the prototype of arrays on GPU to
        # hold accumulated sub count of points in the circle.
        self.h_acc = np.zeros(
            self.threads_per_block * self.blocks, dtype=np.float32)

    def process(self, element: Tuple[int, int]):
        from numba import cuda
        from numba.cuda.random import create_xoroshiro128p_states
        from numba.cuda.random import xoroshiro128p_uniform_float32

        @cuda.jit
        def gpu_monte_carlo_pi_sampler(rng_states, sub_sample_size, acc):
            """Uses GPU to sample random values and accumulates the sub count
            of values within a circle of radius 1.
            """
            pos = cuda.grid(1)
            if pos < acc.shape[0]:
                sub_acc = 0
                for i in range(sub_sample_size):
                    x = xoroshiro128p_uniform_float32(rng_states, pos)
                    y = xoroshiro128p_uniform_float32(rng_states, pos)
                    if (x * x + y * y) <= 1.0:
                        sub_acc += 1
                acc[pos] = sub_acc

        rng_seed, sample_size = element
        d_acc = cuda.to_device(self.h_acc)
        sample_size_per_thread = sample_size // self.h_acc.shape[0]
        rng_states = create_xoroshiro128p_states(self.h_acc.shape[0], seed=rng_seed)
        gpu_monte_carlo_pi_sampler[self.blocks, self.threads_per_block](
            rng_states, sample_size_per_thread, d_acc)
        yield d_acc.copy_to_host()

L'immagine seguente mostra il notebook in esecuzione su una GPU:

Esegui DoFn sulla GPU

Per ulteriori dettagli, consulta il blocco note di esempio Utilizzare le GPU con Apache Beam.

Crea un container personalizzato

Nella maggior parte dei casi, se la pipeline non richiede ulteriori dipendenze Python o eseguibili, Apache Beam può utilizzare automaticamente le sue immagini container ufficiali per eseguire il codice definito dall'utente. Queste immagini includono molti moduli Python comuni e non devi crearli o specificarli in modo esplicito.

In alcuni casi, potresti avere dipendenze Python aggiuntive o persino dipendenze non Python. In questi scenari, puoi creare un container personalizzato e renderlo disponibile per l'esecuzione al cluster Flink. Il seguente elenco fornisce i vantaggi dell'utilizzo di un container personalizzato:

  • Tempi di configurazione più rapidi per esecuzioni consecutive e interattive
  • Configurazioni e dipendenze stabili
  • Maggiore flessibilità: puoi configurare più dipendenze Python

La processo di compilazione del container potrebbe essere noiosa, ma puoi fare tutto nel blocco note utilizzando il seguente pattern di utilizzo.

Creare uno spazio di lavoro locale

Per prima cosa, crea una directory di lavoro locale nella home directory di Jupyter.

!mkdir -p /home/jupyter/.flink

Prepara le dipendenze Python

A questo punto, installa tutte le dipendenze Python aggiuntive che potresti utilizzare ed esportale in un file requirements.

%pip install dep_a
%pip install dep_b
...

Puoi creare esplicitamente un file dei requisiti utilizzando il comando magico del notebook %%writefile.

%%writefile /home/jupyter/.flink/requirements.txt
dep_a
dep_b
...

In alternativa, puoi bloccare tutte le dipendenze locali in un file requirements. Questa opzione potrebbe introdurre dipendenze non intenzionali.

%pip freeze > /home/jupyter/.flink/requirements.txt

Prepara le dipendenze non Python

Copia tutte le dipendenze non Python nel workspace. Se non hai dipendenze non Python, salta questo passaggio.

!cp /path/to/your-dep /home/jupyter/.flink/your-dep
...

Crea un Dockerfile

Crea un Dockerfile con il comando magico del notebook %%writefile. Ad esempio:

%%writefile /home/jupyter/.flink/Dockerfile
FROM apache/beam_python3.7_sdk:2.40.0

COPY  requirements.txt /tmp/requirements.txt
COPY  your_dep /tmp/your_dep
...

RUN python -m pip install -r /tmp/requirements.txt

Il container di esempio utilizza l'immagine dell'SDK Apache Beam versione 2.40.0 con Python 3.7 come base, aggiunge un file your_dep e installa le dipendenze Python aggiuntive. Utilizza questo Dockerfile come modello e modificalo per il tuo caso d'uso.

Nelle pipeline Apache Beam, quando fai riferimento a dipendenze non Python, utilizza le relative destinazioni COPY. Ad esempio, /tmp/your_dep è il percorso del file your_dep.

Crea un'immagine container in Artifact Registry utilizzando Cloud Build

  1. Attiva i servizi Cloud Build e Artifact Registry, se non sono già attivi.

    !gcloud services enable cloudbuild.googleapis.com
    !gcloud services enable artifactregistry.googleapis.com
    
  2. Crea un repository Artifact Registry per poter caricare gli artefatti. Ogni repository può contenere artefatti per un singolo formato supportato.

    Tutti i contenuti del repository sono criptati utilizzando Google-owned and Google-managed encryption keys o chiavi di crittografia gestite dal cliente. Artifact Registry utilizza Google-owned and Google-managed encryption keys per impostazione predefinita e non è necessaria alcuna configurazione per questa opzione.

    Devi disporre almeno dell'accesso in scrittura a Artifact Registry al repository.

    Esegui questo comando per creare un nuovo repository. Il comando utilizza il flag --async e viene restituito immediatamente, senza attendere il completamento dell'operazione in corso.

    gcloud artifacts repositories create REPOSITORY \
    --repository-format=docker \
    --location=LOCATION \
    --async
    

    Sostituisci i seguenti valori:

    • REPOSITORY: un nome per il repository. Per ogni posizione del repository in un progetto, i nomi dei repository devono essere univoci.
    • LOCATION: la posizione del repository.
  3. Prima di eseguire il push o il pull delle immagini, configura Docker per autenticare le richieste per Artifact Registry. Per configurare l'autenticazione nei repository Docker, esegui il seguente comando:

    gcloud auth configure-docker LOCATION-docker.pkg.dev
    

    Il comando aggiorna la configurazione Docker. Ora puoi connetterti con Artifact Registry nel tuo progetto Google Cloud per eseguire il push delle immagini.

  4. Utilizza Cloud Build per creare l'immagine container e salvarla in Artifact Registry.

    !cd /home/jupyter/.flink \
    && gcloud builds submit \
     --tag LOCATION.pkg.dev/PROJECT_ID/REPOSITORY/flink:latest \
     --timeout=20m
    

    Sostituisci PROJECT_ID con l'ID progetto del tuo progetto.

Utilizzo di container personalizzati

A seconda del runner, puoi utilizzare container personalizzati per scopi diversi.

Per informazioni sull'utilizzo generale dei container Apache Beam, consulta:

Per l'utilizzo dei container Dataflow, consulta:

Disabilita indirizzi IP esterni

Quando crei un'istanza notebook Apache Beam, per aumentare la sicurezza, disattiva gli indirizzi IP esterni. Poiché le istanze notebook devono scaricare alcune risorse internet pubbliche, come Artifact Registry, devi prima creare una nuova rete VPC senza un indirizzo IP esterno. Poi, crea un gateway Cloud NAT per questa rete VPC. Per ulteriori informazioni su Cloud NAT, consulta la documentazione di Cloud NAT. Utilizza la rete VPC e il gateway Cloud NAT per accedere alle risorse internet pubbliche necessarie senza attivare indirizzi IP esterni.